Ksiądz Stanisław Maliński oświadczył, że nie współpracował ze służbami specjalnymi PRL. Radiowej Agencji Informacyjnej powiedział, ze jego kontakty ze służbami bezpieczeństwa miały charakter duszpasterski.
"Nie byłem współpracownikiem SB, ani nie podpisywałem żadnej deklaracji współpracy ze służbami bezpieczeństwa. Nie pisałem żadnych donosów, ani informacji o kimkolwiek. Nie otrzymywałem żadnych wynagrodzeń, ani pieniędzy, ani jakichkolwiek gratyfikacji. Moje kontakty miały charakter wyłącznie duszpasterski” – napisał Maliński w oświadczeniu przysłanym IAR.
Ksiądz Maliński dodał również, że o kontaktach tych wiedział ówczesny arcybiskup Krakowa Karol Wojtyła.